Jeux Olympiques de Munich, 5 septembre 1972. Un commando de terroristes palestiniens prend en otage puis exécute onze sportifs israéliens, sous l'oeil des téléspectateurs du monde entier. Inspiré de faits réels, "Munich" retrace le parcours de cinq agents israéliens chargés de traquer les onze Palestiniens considérés comme les commanditaires de l'attentat. Pour mener à bien cette mission, les cinq hommes devront renoncer du jour au lendemain à leur identité et s'exposer à tout moment à la vengeance de leurs cibles.